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bwa: add Spanish translation (#12794)
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kant committed May 18, 2024
1 parent dff913f commit 05d8c44
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25 changes: 25 additions & 0 deletions pages.es/linux/bwa.md
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# bwa

> Herramienta de alineaci贸n Burrows-Wheeler.
> Mapeador de secuencias de ADN cortas y poco divergentes frente a un gran genoma de referencia, como el genoma humano.
> M谩s informaci贸n: <https://github.com/lh3/bwa>.
- Indexa el genoma de referencia:

`bwa index {{ruta/a/referencia.fa}}`

- Mapea las lecturas de un solo extremo (secuencias) al genoma indexado utilizando 32 subprocesos y comprime el resultado para ahorrar espacio:

`bwa mem -t 32 {{ruta/a/referencia.fa}} {{ruta/a/lectura_solo_extremo.fq.gz}} | gzip > {{ruta/a/alineamiento_solo_extremo.sam.gz}}`

- Mapea las lecturas del par final (secuencias) al genoma indexado usando 32 subprocesos y comprime el resultado para ahorrar espacio:

`bwa mem -t 32 {{ruta/a/referencia.fa}} {{ruta/a/lectura_par_final_1.fq.gz}} {{ruta/a/lectura_par_final_2.fq.gz}} | gzip > {{ruta/a/alineamiento_par_final.sam.gz}}`

- Mapea las lecturas del par final (secuencias) al genoma indexado usando 32 subprocesos con [M]arcadores divididos m谩s cortos como secundarios para la compatibilidad del archivo SAM de salida con el software Picard y luego comprime el resultado:

`bwa mem -M -t 32 {{ruta/a/referencia.fa}} {{ruta/a/lectura_par_final_1.fq.gz}} {{ruta/a/lectura_par_final_2.fq.gz}} | gzip > {{ruta/a/alineamiento_par_final.sam.gz}}`

- Mapea las lecturas finales del par (secuencias) al genoma indexado usando 32 subprocesos con [C]omentarios FASTA/Q (p. ej. BC:Z:CGTAC) anexando a un resultado comprimido:

`bwa mem -C -t 32 {{ruta/a/referencia.fa}} {{ruta/a/lectura_par_final_1.fq.gz}} {{ruta/a/lectura_par_final_2.fq.gz}} | gzip > {{ruta/a/lectura_par_final.sam.gz}}`

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