-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 54
/
index.ru.qmd
189 lines (100 loc) · 17.2 KB
/
index.ru.qmd
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
# Добро пожаловать {-}
```{r, out.width = "100%", fig.align = "center", echo=F}
knitr::include_graphics(here::here("images", "Epi R Handbook Banner Russian 1500x500.png"))
# library(knitr)
# opts_chunk$set(list(echo = FALSE, eval = FALSE))
```
<meta name="description" content="The Epi R Handbook is an R reference manual for applied epidemiology and public health.">
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8">
<!-- <span style="color: red;">**ЭТО ПРОЕКТ ДОКУМЕНТА. РЕЦЕНЗЕНТЫ ДАЮТ ОБРАТНУЮ СВЯЗЬ ПО ДАННОЙ [ССЫЛКЕ](https://forms.gle/4RNdRRLGx67xW9yq9)**.</span> -->
<!-- <span style="color: darkgreen;">**ВАМ НРАВИТСЯ ЭТО РУКОВОДСТВО? ЧТО-ТО НУЖНО ИЗМЕНИТЬ? РАССКАЖИТЕ НАМ!**</span> -->
<!-- <form target="_blank" action="https://forms.gle/A5SnRVws7tPD15Js9"> -->
<!-- <input type="submit" value="FEEDBACK" /> -->
<!-- </form> -->
<!-- ======================================================= -->
<!-- ## Справочное руководство по R для прикладной эпидемиологии и общественного здравоохранения {.unnumbered} -->
<!-- <span style="color: brown;">**Справочное руководство по R является справочником для прикладной эпидемиологии и общественного здравоохранения.**</span> -->
<!-- ## О руководстве -->
## R для прикладной эпидемиологии и общественного здравоохранения {-}
**Использование**: Настоящее руководство было использовано более **3 миллиона раз 850 000 человек** по всему миру.
**Задача:** Служит кратким справочником по R (онлайн и [**оффлайн**](data_used.ru.qmd)) с примерами, ориентированными на задачи, которые направлены на часто встречающиеся проблемы в эпидемиологии.
**Вы только начинаете работать с R?** Воспользуйтесь нашими **[бесплатными интерактивными самоучителями](https://www.appliedepi.org/tutorial/)** или синхронным виртуальным **[вводным курсом](https://www.appliedepi.org/live/)** который используют CDC США, ВОЗ, а также более 400+ других медицинских организаций и Программ обучения прикладных эпидемиологов по всему миру.
**Языки:** [Английский (English)](https://epirhandbook.com/en/), [Французский (Français)](https://epirhandbook.com/fr), [испанский (Español)](https://epirhandbook.com/es/), [вьетнамский (Tiếng Việt)](https://epirhandbook.com/vn/), [Японский (日本)](https://epirhandbook.com/jp/), [турецкий (Türkçe)](https://epirhandbook.com/tr/), [португальский (Português)](https://epirhandbook.com/pt), [Русский](https://epirhandbook.com/ru)
<!-- * Использует практические примеры из эпидемиологии - вычистка построчных списков случаев, создание цепочек передачи и эпидемических кривых, автоматизированные отчеты и информационные панели, моделирование заболеваемости и прогнозирование, демографические пирамиды и стандартизация показателей, сопоставление записей, обнаружение вспышек, анализ исследований, основы ГИС, отслеживание контактов, филогенетические деревья... -->
<!-- **Чем руководство отличается от других учебников по R?** -->
<!-- * Разрабатывается самим сообществом - *написано эпидемиологами для эпидемиологов* в свободное время, используя опыт работы на местном, национальном уровнях, в академической среде, а также в условиях чрезвычайных ситуаций -->
<!-- Двухколоночный вид создан на основе руководства по rmarkdown: https://bookdown.org/yihui/rmarkdown-cookbook/multi-column.html -->
<!-- <form target="_blank" action="https://www.paypal.com/donate?hosted_button_id=YTEZELC8VBXV6"> -->
<!-- <input type="submit" value="Donate to maintain this resource" /> -->
<!-- </form> -->
<br>
<span style="color: black;">**Written by epidemiologists, for epidemiologists**</span>
:::: {style="display: flex;"}
::: {}
```{r, out.width = "100%", fig.align = "center", echo=F}
knitr::include_graphics(here::here("images", "Applied_Epi_logo.png"))
```
:::
::: {.col data-latex="{0.05\textwidth}"}
\
<!-- Пустой Div (с пробелом), служит разделителем столбцов
-->
:::
::: {}
**[Applied Epi](http://www.appliedepi.org)** - некоммерческая организация и движение специалистов прикладной эпидемиологии по всему миру. Мы пишем в свободное время, чтобы дать сообществу ресурсы. Ваши комментарии и обратная связь приветствуются:
* Посетите наш **[веб-сайт](http://www.appliedepi.org)** и **[присоединяйтесь к списку контактов](https://forms.gle/9awNd8syypTSYUsn7)**
* **contact@appliedepi.org**, твиттер **[\@appliedepi](https://twitter.com/appliedepi)**, или **[LinkedIn](www.linkedin.com/company/appliedepi)**
* О проблемах сообщайте в нашем **[репозитории Github](https://github.com/appliedepi/epiRhandbook_eng)**
**Мы предлагаем онлайн обучение по R** от инструкторов с десятилетиями опыта в прикладной эпидемиологии - [www.appliedepi.org/live](www.appliedepi.org/live).
:::
::::
<form target="_blank" action="https://www.paypal.com/donate" method="post" target="_top">
<input type="hidden" name="hosted_button_id" value="YTEZELC8VBXV6" />
<input type="image" src="https://github.com/appliedepi/epiRhandbook_eng/raw/master/images/donate_button_long.png" border="0" name="submit" title="PayPal - The safer, easier way to pay online!" alt="Donate with PayPal button" />
<img alt="" border="0" src="https://www.paypal.com/en_US/i/scr/pixel.gif" />
</form>
<!-- ======================================================= -->
## Как пользоваться этим руководством {-}
* Просматривайте страницы в Содержании, либо используйте поле поиска
* Кликните на икноки "копировать", чтобы скопировать код
* Вы можете работать параллельно с помощью [примера данных](data_used.ru.qmd)
**Оффлайн версия**
См. инструкции на странице [Скачивание руководства и данных](data_used.ru.qmd).
<!-- ======================================================= -->
## Благодарности {-}
Данное руководство подготовлено независимой группой эпидемиологов со всего мира на основе опыта работы с организациями, включая местные, государственные, провинциальные и национальные органы здравоохранения, Всемирную организацию здравоохранения (ВОЗ), организацию "Врачи без границ" (MSF), больничные системы и академические институты.
Настоящее руководство **не** является одобренным продуктом какой-то отдельной организации. Хотя мы стремимся обеспечить правильность, мы не предоставляем гарантий касательно содержания этой книги.
### Участвовали в подготовке {-}
**Редактор:** [Neale Batra](https://www.linkedin.com/in/neale-batra/)
**Авторы**: [Neale Batra](https://www.linkedin.com/in/neale-batra/), [Alex Spina](https://github.com/aspina7), [Paula Blomquist](https://www.linkedin.com/in/paula-bianca-blomquist-53188186/), [Finlay Campbell](https://github.com/finlaycampbell), [Henry Laurenson-Schafer](https://github.com/henryls1), [Isaac Florence](www.Twitter.com/isaacatflorence), [Natalie Fischer](https://www.linkedin.com/in/nataliefischer211/), [Aminata Ndiaye](https://twitter.com/aminata_fadl), [Liza Coyer]( https://www.linkedin.com/in/liza-coyer-86022040/), [Jonathan Polonsky](https://twitter.com/jonny_polonsky), [Yurie Izawa](https://ch.linkedin.com/in/yurie-izawa-a1590319), [Chris Bailey](https://twitter.com/cbailey_58?lang=en), [Daniel Molling](https://www.linkedin.com/in/daniel-molling-4005716a/), [Isha Berry](https://twitter.com/ishaberry2), [Emma Buajitti](https://twitter.com/buajitti), [Mathilde Mousset](https://mathildemousset.wordpress.com/research/), [Sara Hollis](https://www.linkedin.com/in/saramhollis/), Wen Lin
**Рецензенты и лица, оказавшие поддержку**: Pat Keating, [Amrish Baidjoe](https://twitter.com/Ammer_B), Annick Lenglet, Margot Charette, Danielly Xavier, Marie-Amélie Degail Chabrat, Esther Kukielka, Michelle Sloan, Aybüke Koyuncu, Rachel Burke, Kate Kelsey, [Berhe Etsay](https://www.linkedin.com/in/berhe-etsay-5752b1154/), John Rossow, Mackenzie Zendt, James Wright, Laura Haskins, [Flavio Finger](ffinger.github.io), Tim Taylor, [Jae Hyoung Tim Lee](https://www.linkedin.com/in/jaehyoungtlee/), [Brianna Bradley](https://www.linkedin.com/in/brianna-bradley-bb8658155), [Wayne Enanoria](https://www.linkedin.com/in/wenanoria), Manual Albela Miranda, [Molly Mantus](https://www.linkedin.com/in/molly-mantus-174550150/), Pattama Ulrich, Joseph Timothy, Adam Vaughan, Olivia Varsaneux, Lionel Monteiro, Joao Muianga
**Иллюстрации**: Calder Fong
<!-- **Главный редактор:** Neale Batra -->
<!-- **Основная команда проекта:** Neale Batra, Alex Spina, Amrish Baidjoe, Pat Keating, Henry Laurenson-Schafer, Finlay Campbell -->
<!-- **Авторы**: Neale Batra, Alex Spina, Paula Blomquist, Finlay Campbell, Henry Laurenson-Schafer, [Isaac Florence](www.Twitter.com/isaacatflorence), Natalie Fischer, Aminata Ndiaye, Liza Coyer, Jonathan Polonsky, Yurie Izawa, Chris Bailey, Daniel Molling, Isha Berry, Emma Buajitti, Mathilde Mousset, Sara Hollis, Wen Lin -->
<!-- **Рецензенты**: Pat Keating, Mathilde Mousset, Annick Lenglet, Margot Charette, Isha Berry, Paula Blomquist, Natalie Fischer, Daniely Xavier, Esther Kukielka, Michelle Sloan, Aybüke Koyuncu, Rachel Burke, Daniel Molling, Kate Kelsey, Berhe Etsay, John Rossow, Mackenzie Zendt, James Wright, Wayne Enanoria, Laura Haskins, Flavio Finger, Tim Taylor, Jae Hyoung Tim Lee, Brianna Bradley, Manual Albela Miranda, Molly Mantus, Priscilla Spencer, Pattama Ulrich, Joseph Timothy, Adam Vaughan, Olivia Varsaneux, Lionel Monteiro, Joao Muianga -->
### Финансирование и поддержка {-}
Настоящее руководства является проектом преимущественно на добровольной основе, на создание которого ушли тысячи часов.
Руководство получало некоторое поддерживающее финансирование через грант по наращиванию потенциала в контексте COVID-19 от [TEPHINET](https://www.tephinet.org/), глобальной сети Программ обучения прикладных эпидемиологов (FETP).
Административную поддержку предоставила сеть выпускников EPIET ([EAN](https://epietalumni.net/)), особая благодарность выражается Аннике Уендланд. EPIET - европейская программа обучения интервенционной эпидемиологии.
Особая благодарность организации Врачи без границ (MSF), Операционному центру в Амстердами (OCA) за поддержку в разработке настоящего руководства.
*Данная публикация была поддержана Соглашением о сотрудничестве номер NU2GGH001873, финансируемым Центрами по контролю и профилактике заболеваний через TEPHINET, программой Рабочей группы по глобальному здоровью (Task Force for Global Health). Ответственность за содержание публикации лежит исключительно на авторах, и оно не обязательно отражает официальную точку зрения Центров по контролю и профилактике заболеваний, Министерства здравоохранения и социальных служб, Task Force for Global Health, Inc. или TEPHINET.*
### Вдохновение {-}
На соответствующих страницах делаются отсылки на ряд самоучителей и виньеток, которые представили информацию для разработки содержания руководства.
В целом, источниками вдохновения для настоящего руководства были:
[Проект "R4Epis"](https://r4epis.netlify.app/) (a collaboration between MSF and RECON)
[R Epidemics Consortium (RECON)](https://www.repidemicsconsortium.org/)
[Книга R for Data Science (R4DS)](https://r4ds.had.co.nz/)
[bookdown: Authoring Books and Technical Documents with R Markdown](https://bookdown.org/yihui/bookdown/)
[Netlify](https://www.netlify.com) hosts this website
<!-- ### Изображения {-} -->
<!-- Изображения в лого из библиотеки изображений для общественного здравоохранения CDC США) включают [места размножения комаров в Йемене 2013](https://phil.cdc.gov/Details.aspx?pid=19623), [вирус Эбола](https://phil.cdc.gov/Details.aspx?pid=23186), и [Исследование в Раджастане](https://phil.cdc.gov/Details.aspx?pid=19838). -->
## Условия использования и участия {-}
### Лицензия {.unnumbered}
<a rel="license" href="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/"><img alt="Creative Commons License" style="border-width:0" src="https://i.creativecommons.org/l/by-nc-sa/4.0/88x31.png" /></a> Applied Epi Incorporated, 2021 <br />Данная работа лицензирована Applied Epi Incorporated в рамках лицензии <a rel="license" href="http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/">Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License</a>.
Академические курсы и программы обучения эпидемиологов могут связаться с нами по вопросам использования или адаптации этих материалов (email **contact@appliedepi.org**).
### Цитирование {.unnumbered}
Batra, Neale, et al. The Epidemiologist R Handbook. 2021. <a rel="license" href="https://zenodo.org/badge/231610102.svg"><img alt="DOI" style="border-width:0" src="https://zenodo.org/badge/231610102.svg" /></a><br />
### Участие {.unnumbered}
Если вы хотите внести свой вклад в разработку содержания, сначала свяжитесь с нами через Github issues или по электронной почте. Мы разрабатываем график обновлений и создаем руководство для разработчиков.
Обратите внимание, что проект epiRhandbook разрабатывается на основе [Кодекса поведения участников](https://contributor-covenant.org/version/2/0/CODE_OF_CONDUCT.html). Принимая участие в разработке, вы соглашаетесь с этими условиями.